武阳丰等：食疗缓解高血压！符合中国人口味的降压循证饮食来了

现出结论，消化道肠道不良是暖和关的AF的一个取而代之诱因，特定肠道和肠道特异开放性或是其取而代之的干预靶标。（@Bingbing）

【原意文档】

Akkermansia muciniphila prevents cold-related atrial fibrillation in rats by modulation of TMAO induced cardiac pyroptosis

2022-07-04, doi: 10.1016/j.ebiom.2022.104087

重庆师范大学：消化道肠道参与精神病的潜在取而代之机制

Journal of Advanced Research——[12.822]

① 共13个酵母属与抑郁行为（DLB）没人注意关的，其中的7个归入厚壁酵母门；② 小鼠粪便中的脂质人体内的差别主要归入甲醇磷脂（GP）和不饱和脂肪酸酸（FA）的人体内，且有3个“特异开放性类型-细酵母类集合起来”关的对：FA/GP-厚壁酵母门、FA/GP-赖特氏酵母、FA/GP-双歧杆酵母；③ 与DLB关的的最关键没人注意差别脂人体内是GP和FA的人体内，DLB关的基因也在GP/FA人体内中的钼，且SCFAs与差别酵母没人注意关的；④ 白复合物和脑的差别脂人体内主要是GP人体内，并且脑样本谷氨酸捷径中的国有4种神经递质。

【撰稿赞不绝口】

重庆师范大学陈建军团队人类学家成果。随着人类学家的集中，肠-脑轴越来越被大家集中认识。本文聚焦消化道肠道与抑郁关的行为（DLB）的关的开放性。人类学家得显现出结论，消化道肠道确实通过阻碍外周/中的枢的甲醇磷脂（GP）人体内造成DLB，厚壁酵母门-短链不饱和脂肪酸酸（SCFAs）-GP人体内-谷氨酸捷径是潜在机制。（@Bingbing）

【原意文档】

Multi-omics data reveals the disturbance of glycerophospholipid metabolism caused by disordered gut microbiota in depressed mice

2021-10-13, doi: 10.1016/j.jare.2021.10.002

常用型肝癌微生物体和人体内标志物

Microbiology spectrum——[9.043]

① 多种原理对来自多种不同地区CRC微生物体集合起来数据库顺利进行meta统计分析确认了一分组CRC的全球开放性生物体标记物，并确认一种取而代之的生物体标记物a.onderdonkii；② 共发生网络统计分析显示CRC中的的整体微生物体联系减极多，并假定气管致病微生物体集合起来；③ CRC中的氨基酸、尸胺和肌酸显现出现钼，与CRC关的微生物体如Bacteroides fragilis棱关的，与对应关的微生物体如Faecalibacterium prausnitzii呈负关的④ 而丁酸、天冬氨酸、酪氨酸、谷氨酸和2-羟基丁酸与对应关的微生物体棱关的。

【撰稿赞不绝口】

Microbiology spectrum现阶段公整合表的撰文，通过对多种不同地区的结直肠癌（CRC）患者的聪序列数据库库顺利进行荟萃统计分析，鉴定显现出一分组CRC生物体标志物，在多种不同地区都常用；同时报道了与肝癌关的的没人注意差别特异开放性和微生物体特异开放性相互作用。（@章台柳）

【原意文档】

Meta-Analysis of Altered Gut Microbiota Reveals Microbial and Metabolic Biomarkers for Colorectal Cancer

2022-06-29, doi: 10.1128/spectrum.00013-22

StrainXpress：一种针对聪序列数据库更快恰当的分制造原理

Nucleic Acids Research——[19.16]

① 微生物体同种多种不同株间的细微差别为从聪序列数据库中的分制造恢复序列造成了挑战；② StrainXpress是一种基于OLC（overlap-layout-consensus）算法的从头分制造原理，采取分而治之策略，针对NGS数据库可以在酵母株分辨叛将下分制造显现出单个序列；③ StrainXpress能从包含上千酵母株的聪序列数据库中的整修酵母株的序列，也能有畸变对低覆盖度的酵母株；④ 在演示和真实世界数据库集中的，StrainXpress整修酵母株特异开放性序列的总数平均最少当前最先进原理的26.75%。

【撰稿赞不绝口】

随着下一代分子生物学关键技术的发展以及分子生物学成本的降低，多种分制造原理已经被整合在物种程度上识别系统和整修序列。然而，它们在酵母株程度上区隔序列的并能仍有很大的优化空间。据悉，人类学家技术人员在Nucleic Acids Research公整合表最取而代之人类学家，他们整合了StrainXpress基本功能，基于OLC（overlap-layout-consensus）算法从头分制造，可以更快恰当地从聪序列数据库中的分制造显现出单个序列，通过演示和真实世界数据库也推论StrainXpress基本功能整修酵母株特异开放性序列的总数高于当前最先进的原理，没人关的技术人员关注和测试。（@六部弼）

【原意文档】

StrainXpress: strain aware metagenome assembly from short reads

2022-07-01, doi: 10.1093/nar/gkac543

莲港城市大学：PhaMer可从聪序列数据库中的恰当识别系统酵母酵母

Briefings in Bioinformatics——[13.994]

① 高多元开放性/核素、参考序列有限等原因实质上着从聪序列数据库中的恰当和全面地检测酵母酵母，现有基于统计分析或学习的基本功能普遍假定被免职叛将和准确开放性无法考虑到的疑虑；② PhaMer有别于可自主学习复合物质分组成和关连开放性的语言模型Transformer来鉴定酵母酵母；③ 基于演示和真实世界数据库的测试，PhaMer的恰当度高于其它5个主流酵母酵母鉴定基本功能（Seeker、DeepVirfinder、VirFinder、PPR-meta、VirSorter）；④ 在真实世界数据库中的，PhaMer可将酵母酵母检测的F1-score降低27%。

【撰稿赞不绝口】

近年来，聪序列分子生物学关键技术已经成为一种取而代之的酵母酵母识别系统意图，它可以对来自各种微生物体集合起来的所有生物体顺利进行分子生物学，基于序列统计分析或神经网络的酵母酵母识别系统基本功能也被陆续整合。据悉，莲港城市大学孙燕妮及团队在Briefings in Bioinformatics公整合表最取而代之人类学家，基于语言模型Transformer整合了PhaMer（）基本功能，通过演示和真实世界数据库的测试，发掘显现出PhaMer的恰当度高于目前的主流酵母酵母鉴定基本功能，没人关的技术人员关注和测评。（@六部弼）

【原意文档】

Accurate identification of bacteriophages from metagenomic data using Transformer

2022-06-30, doi: 10.1093/bib/bbac258

国外团队：土源细酵母或能赋予泡茶籽熊愈来愈极强的泡茶皂素抵抗并能

Microbiome——[16.837]

① 与花生相对来说，含水微生物体集合起来是油菜蟑螂泡茶籽熊消化道肠道的主要来源，其中的不进杆酵母属核素极高；② 不进杆酵母中的泡茶皂素（油菜的一种防御开放性次级特异开放性）裂解关的人体内通路没人注意钼，粘液科学实验确认不进杆酵母较强裂解泡茶皂素并能；③ 萤光标记科学实验推论，不进杆酵母AS23酵母株可以从含水迁移到油菜熊幼虫消化道中的，赋予其裂解泡茶皂素的并能，使其耐受开放性油菜种子中的的泡茶皂素从而能够在油菜种子中的穴居；④ 含水来源的消化道肠道赋予了泡茶籽熊愈来愈极强的植物学毒素耐受开放性并能。

【撰稿赞不绝口】

油菜是我国特有的木本油料作物，泡茶油色清味莲、摄取多样、耐积存，是优质食用油，也可作为市售、防锈油用于工业。然而，泡茶籽熊及炭疽病的一触即发，是油菜低产的举足轻重原因。据悉，江苏农林大学周旭东、中的国林业科学院舒人口为120人及团队在Microbiome公整合表最取而代之人类学家，发掘显现出泡茶籽熊的消化道肠道受含水的微生物体集合起来的阻碍要极小花生微生物体集合起来。含水中的不进杆酵母属核素极高，可在泡茶籽熊消化道中的发挥皂苷裂解功能，并且通过萤光标记科学实验推论了含水来源的不进杆酵母AS23赋予了泡茶籽熊愈来愈极强的泡茶皂素抵抗并能。总之，该人类学家为期望解决油菜病虫害的防治疑虑较强举足轻重指导含义。（@六部弼）

【原意文档】

Soil-derived bacteria endow Camellia weevil with more ability to resist plant chemical defense

2022-06-25, doi: 10.1186/s40168-022-01290-3

韦中的+周取而代之刚：国外团队探究生物体炭抑制作物土传传染病机理

iMeta——[N/A]

① 落叶科学实验发掘显现出生物体炭降低了番茄枯萎传染病；② 根际肠道重制科学实验表明生物体炭降低了番茄根际肠道对枯萎病的抑制并能；③ 16S rRNA基因高通量分子生物学以及粘液培养科学实验进一步探究了番茄根际所召募的抑病型根际肠道与植物学益处微生物体(如假单胞酵母)的降低有关；④ 生物体炭增极强了番茄根系皮肤上对益处微生物体的吸引开放性和加强生物体膜形成的并能；⑤ 生物体炭能加强番茄有效开放性地召募抑病型根际肠道来抗击枯萎病。

【撰稿赞不绝口】

农学韦中的和东北工业大学周取而代之刚与团队，现阶段在iMeta公整合表人类学家，探究了生物体炭是否是能加强植物学召募益处细酵母到根际，从而形成抑病型根际肠道。本人类学家表明，生物体炭增极强了番茄根际肠道的抑病并能，能加强番茄有效开放性地召募抑病型根际肠道来抗击枯萎病。本人类学家结果让人们认识到通过工业安全措施增极强对根际益处肠道的召募会有助于抑制土传传染病，并可降低工业可持续开放性。（@刘永鑫-清华大学-聪序列）

【原意文档】

Biochar stimulates tomato roots to recruit a bacterial assemblage contributing to disease resistance against Fusarium wilt

2022-06-23, doi: 10.1002/imt2.37

感谢本期周报的创作者：mildbreeze，Bingbing，WK红叶，Akkk，往、昔℡，芥末，刘永鑫-清华大学-聪序列

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